Trường THPT Giồng Ông Tố là trường dạy học theo mô hình trường học 2 buổi/ngày gồm chương trình chính khóa theo quy định của Bộ GD&ĐT và các môn học tăng cường ở buổi 2 với định hướng đến sự phát triển toàn diện của học sinh gồm: hoạt động dạy học nâng cao theo các khối thi Đại học – Cao đẳng; tăng cường tiếng Anh với giáo viên nước ngoài; tin học quốc tế; các câu lạc bộ học thuật, thể thao, văn nghệ; học tập trải nghiệm ngoài nhà trường và nhiều các hoạt động đa dạng phù hợp với từng đối tượng học sinh. Bên cạnh đó, một trong những điểm mạnh của nhà trường phải nhắc đến chính là công tác đào tạo, bồi dưỡng học sinh tham gia các kỳ thi cấp thành phố như Olympic Tháng 4, Học sinh giỏi lớp 12 cấp thành phố, hội thi Đầu bếp trẻ cấp thành phố.
Về cơ sở vật chất, gồm có 33 phòng học được trang bị máy chiếu, máy điều hòa; 3 phòng tin học với hơn 140 máy vi tính; 3 phòng thí nghiệm Lý (tích hợp học phòng STEM), Hóa, Sinh; hệ thống máy lọc nước tinh khiết phục vụ học sinh; Không gian tự học thoáng mát, gần gũi với thiên nhiên; dịch vụ bán trú máy lạnh phục vụ cho học sinh nhà xa hoặc Cha Mẹ không tiện đưa đón buổi trưa.