Về thành tích của học sinh, trường THCS Phú Diễn được đứng đầu các trường trong khối công lập của Quận về chất lượng mũi nhọn trong kì thi HSG với 12 giải thành phố, 33 giải HSG cấp Quận và rất nhiều giải ở các cuộc thi khác như Timo (18 giải), HKISO (4 giải), HKIMO (12 giải), HKICO (4 giải), Poster (3 giải),… Hoạt động văn hóa, văn nghệ, thể dục – thể thao của học sinh nhà trường cũng đạt được những thành tích đáng ghi nhận với 2 huy chương bạc cấp thành phố môn Cờ tướng và Taekwondo, 1 huy chương đồng cấp thành phố môn Karatedo, trong chung kết toàn quốc cuộc thi “Cùng Đức Việt và Miwon trở thành Trạng nguyên tuổi 13”,