Trường TH&THCS Hoàng Châu được thành lập năm 1965 với tiền thân là Trường cấp I trong điều kiện cơ sở vật chất khó khăn thiếu thốn. Từ năm 1976 đến năm 1980 trường đã có 2 cấp học mang tên Trường cấp I – II Hoàng Châu.

Sau nửa thế kỷ từ ngày thành lập, năm 2006 nhà trường được UBND huyện phê duyệt mở rộng diện tích và xây mới lại toàn bộ ngôi trường theo hướng kiên cố hóa trường học, hoàn thành vào tháng 11 năm 2008. Tháng 8 năm 2010 Trường đổi tên thành Trường Tiểu học và Trung học cơ sở Hoàng Châu.