Trường TH, THCS và THPT Tân Phú có chất lượng giáo dục hàng đầu tại Thành phố Hồ Chí Minh. Tỷ lệ học sinh giỏi cấp Thành phố luôn ở top đầu của Thành phố, tỷ lệ học sinh tốt nghiệp THPT nhiều năm liền đạt 100%, tỷ lệ học sinh trúng tuyển vào các trường Đại học nhiều năm liền đạt 98%.
Đặc biệt Trường TH, THCS và THPT Tân Phú là trường duy nhất của Thành phố Hồ Chí Minh đạt giải Nhất cuộc thi Khoa học kĩ thuật cấp Quốc gia năm học 2018-2019. Năm học 2019-2020 trường tiếp tục đại diện cho Thành phố Hồ Chí Minh tham gia vòng chung kết cuộc thi Khoa học kĩ thuật cấp Quốc gia và là trường tư thục duy nhất của Thành phố tham gia vòng chung kết cấp Quốc gia. Với nhiều thành tích vượt trội trường vinh dự được Thủ tướng Chính phủ tặng bằng khen, nhiều năm liền được UBND Thành phố, Bộ Giáo dục và Đào tạo tặng bằng khen về thành tích xuất sắc đổi mới sáng tạo trong dạy và học.