Trường Phan Châu Trinh được thành lập từ năm 2000. Với hơn 20 năm hoạt động, chất lượng đào tạo của trường ngày một được nâng lên. Hằng năm, tỉ lệ học sinh đạt Tốt nghiệp THPT đều vượt mức bình quân của Thành phố. Trường Phan Châu Trinh là một cơ sở giáo dục phổ thông chính quy, giống như các cơ sở giáo dục phổ thông công lập như Mạc Đĩnh Chi, Bình Phú, An Lạc…. Do đó chương trình học hoàn toàn giống như trường công lập. Tất cả hoạt động chuyên môn, thi cử (thi Học sinh giỏi các cấp, thi Nghề phổ thông, thi Tốt nghiệp, hoạt động nghiên cứu khoa học…) đều thực hiện cùng với các trường công lập thành một khối thống nhất của cơ sở giáo dục phổ thông toàn thành phố.