Trường Đại học Phú Yến là một trường đại học địa phương, đào tạo đa ngành, đa cấp, đáp ứng nhu càu nguồn nhân lực chất lượng cao phục vụ cho sự nghiệp phát triển kinh tế – xã hội của tỉnh Phú Yên và góp phần phát triển nguồn nhân lực cho khu vực Nam trung bộ và Tây Nguyên.